鼹鼠儿科前沿

MLPA（Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification）和一代测序（Sanger测序）是两种不同的分子检测技术，它们在遗传学研究和临床诊断中各有其应用场景和特点：

MLPA（多重连接探针扩增）
– 原理：MLPA是一种相对定量的分子诊断技术，它通过设计特异性的探针来检测DNA中的拷贝数变异（CNVs），包括基因的缺失或重复。这些探针能够识别目标序列，经过连接、PCR扩增，最后通过电泳分离和检测荧光信号强度来确定目标序列的相对数量。
– 应用：主要用于已知基因或区域的拷贝数异常检测，如遗传病的快速筛查、肿瘤的基因重排检测等。
– 优势：操作相对简便快捷，成本相对较低，适合于针对特定基因或区域的批量检测。
– 局限性：分辨率有限，主要针对已知的遗传变异，无法发现新的或未知的变异。

一代测序（Sanger测序）
– 原理：也称为双脱氧终止法，是经典的DNA测序技术。通过添加带有终止核苷酸的ddNTPs到正在延伸的DNA链中，终止DNA合成，产生一系列长度不一的DNA片段，通过凝胶电泳分离，根据片段大小确定碱基序列。
– 应用：常用于小规模测序任务，如验证已知变异、测序PCR产物、测序较小的基因或基因片段，以及作为其他测序技术的质量控制。
– 优势：读长长，准确性高，结果稳定可靠，适用于低通量测序需求。
– 局限性：通量低，成本相对较高，不适合大规模基因组或外显子组测序。

主要区别
– 技术原理：MLPA基于PCR扩增和探针杂交来检测拷贝数变异，而一代测序则是基于DNA合成终止和电泳分离来确定碱基序列。
– 应用范围：MLPA更适合于已知基因或区域的拷贝数变异检测，而一代测序适用于小片段DNA的精确测序。
– 通量和成本：一代测序通量低，成本相对较高，而MLPA虽通量较NGS低，但相比一代测序在某些情况下可能更经济高效。
– 信息深度：一代测序可以获得准确的碱基序列信息，而MLPA提供的是相对定量的拷贝数变化信息，而非直接的序列信息。