在诊断不完全性川崎病前,必须仔细地排除其他可引起发热、皮疹及相似实验室检查异常的疾病。多种炎症性和感染性疾病,包括腺病毒、非典型麻疹、结节病、结节性多动脉炎和全身型幼年特发性关节炎(systemic juvenile idiopathic arthritis, SJIA),都曾被误诊为不完全性川崎病。成人中需排除的主要诊断是药物超敏反应和中毒性休克综合征。

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